細菌是原核生物（prokaryote），可以自己複製、製造蛋白質，也有許多人類細胞沒有的結構，例如 peptidoglycan（肽聚醣）、70S ribosome（70S 核糖體）、DNA gyrase（DNA 旋轉酶）。這些差異就是抗生素選擇性毒性的來源。真核微生物（eukaryote）如黴菌與寄生蟲和人體比較相似，因此治療常比較容易傷到宿主；病毒更極端，它必須借用宿主細胞，治療常鎖定 viral polymerase（病毒聚合酶）、protease（蛋白酶）、entry（進入）或 release（釋放），而不是傳統細菌靶點。
Prion 則不在這個框架內。它不含核酸，核心是錯摺蛋白造成其他蛋白構形改變，因此對一般核酸或細胞壁概念都不適用。
| 類別 | 代表 | 核心結構 | 國考讀法 |
| 細菌 | Staphylococcus、E. coli、結核菌 | Peptidoglycan、70S ribosome、多為環狀 DNA | 抗生素靶點最多，先問 Gram stain、氧氣需求、毒力因子 |
| 黴菌 | Candida、Aspergillus | 真核、ergosterol（麥角固醇）、chitin/glucan | 抗黴菌藥打 ergosterol 或 cell wall glucan |
| 寄生蟲 | Plasmodium、Giardia、helminths | 真核，生活史複雜、含 cholesterol | 感染途徑、移行路徑、eosinophilia 比細胞結構更重要 |
| 病毒 | HBV、HIV、influenza | 無細胞壁，靠宿主細胞複製 | 有無 envelope、基因體種類、疫苗與抗病毒藥靶點 |
| Prion | CJD | 錯摺蛋白，不含核酸 | 快速進行失智、myoclonus、海綿狀變化 |
原核 vs 真核：國考細節對照
這張表是國考基礎題的固定考點，重點放在核糖體、sterol、細胞壁成分與原核「五無」。
| 項目 | 原核（細菌） | 真核（黴菌/寄生蟲/人） |
| 核糖體 | 70S（= 50S + 30S） | 80S（= 60S + 40S） |
| 細胞膜 sterol | 無 sterol | 黴菌 ergosterol、寄生蟲/人 cholesterol |
| 細胞壁 | Peptidoglycan、diaminopimelic acid | 真菌 chitin、glucan、mannoprotein；寄生蟲/動物細胞無 |
| 染色體 | 多為單一環狀、haploid，位於 nucleoid | 多條、diploid、包 histone、位於核內 |
| 複製 | 二分法（binary fission） | 有絲/減數分裂、有 G/S phase |
| 原核「五無」 | 無核仁、無中心粒、無粒線體、無 introns、無內質網/高基氏體 | 皆有 |
70S/80S 的差異，就是 aminoglycoside、tetracycline、macrolide 等能選擇性打細菌核糖體的根本；ergosterol 則是抗黴菌藥的靶點。