8.3.1　聚合反應的立體化學 DNA polymerase 反應： (DNA)_n – 3'-OH + dNTP → (DNA)_{n+1} – 3'-OH + PPi 已延長鏈最末端的 3'-OH（親核）攻擊進入的 dNTP 的 α-磷酸（5' 磷酸），離開 PPi（焦磷酸）。 方向永遠 5' → 3'（就新合成的股而言）。 不需 ATP（能量來自 dNTP 水解 → PPi）；需 Mg²⁺（穩定轉換態、輔酶）、需 dNTPs、需 primer 提供 3'-OH。 為什麼合成是不可逆的：磷酸二酯鍵的生成本身能量上接近持平，真正把反應拉向前的是釋出的焦磷酸（PPi）。細胞內含量豐富的無機焦磷酸酶（inorganic pyrophosphatase）立刻把 PPi 水解為 2 個無機磷酸（2 Pi），這步強放能，使整體自由能變為負值、實質上不可逆。少了這一拉力，逆反應（pyrophosphorolysis，焦磷酸解）就會把剛接上的核苷酸切回來。 國考：「DNA 聚合反應不需加什麼？」答案 ATP（ATP 是解旋酶、連接酶等周邊需要，DNA 合成主反應本身不需要）。 「聚合反應方向可為 5'→3' 或 3'→5'」錯！只能 5'→3'。 8.3.2　為什麼需要 RNA 引子（primer）？ DNA pol 不會 de novo 起頭，它必須接在一個已有 3'-OH 的短序列後面延伸。 Primase 先用 NTPs 合成短 RNA（~10 nt）提供第一個 3'-OH，DNA pol 才能接著合成 DNA。 國考：原核與真核複製皆需 RNA primer（不是 DNA primer）。原核 primer 由 DnaG（primase） 合成；真核由 DNA polymerase α–primase 複合物合成。