B 型 DNA 雙螺旋：反平行、右旋、10 鹼基對/圈、相鄰鹼基 3.4 Å。 8.2.1　Watson–Crick 模型 5 大重點 反平行（antiparallel）：一股 5'→3'，對側 3'→5'。 右旋（right-handed）：B 型、A 型。 磷酸-五碳糖骨架在外、鹼基對在內（疏水堆疊）。 鹼基配對：A=T（2 個氫鍵）、G≡C（3 個氫鍵）；嘌呤配嘧啶（兩股間距僅足容一嘌呤+一嘧啶，不能雙嘌呤或雙嘧啶）。 相鄰鹼基距離 3.4 Å：每圈 10 bp（B 型）。 8.2.2　A / B / Z 三種螺旋型 型態 旋向 每鹼基間距 每圈 bp 出現環境 A-form 右旋 2.6 Å 11 脫水條件；RNA 雙股、DNA–RNA hybrid 傾向此構型 B-form 右旋 3.4 Å 10 生理條件下 DNA 主要構型（最穩定） Z-form 左旋 3.7 Å 12 高鹽、GC-rich、CpG 甲基化；可能與基因調控相關（Z = zigzag 磷酸骨架，左旋得名由此） 8.2.3　大溝與小溝 B 型 DNA 有 major groove（大溝） 與 minor groove（小溝）；DNA 結合蛋白（如轉錄因子、限制酶）主要從大溝辨識序列特異性。 8.2.4　G-quadruplex（G-四聯體） 四個鳥嘌呤（G）經 Hoogsteen 氫鍵環繞中心 K⁺ 形成 G-tetrad，層層堆疊即 G-quadruplex。 端粒（telomere） 3' 懸空尾（TTAGGG 重複）是 G-rich 單股，可自我纏繞成 四股結構（G-quadruplex）。 扮演基因表達調控、端粒保護角色；也出現於部分致癌基因啟動子。 國考題：「端粒鳥嘌呤含量高之單股 DNA 以何種結構穩定？」答案 四股 DNA（G-quadruplex）。 8.2.5　組蛋白與染色質包裝 Histones（組蛋白）：富含鹼性胺基酸（Lys、Arg），帶正電，與 DNA 帶負電的磷酸骨架靜電結合。 基本單位 nucleosome = 147 bp DNA 繞 8 聚體（H2A×2、H2B×2、H3×2、H4×2）；H1 是 linker histone。 染色質由 nucleosome → 30 nm fiber → 高階摺疊 → 染色體。 8.2.6　CpG 甲基化（真核 epigenetics） 真核細胞中 CpG site（C-phosphate-G 序列） 之 cytosine 易被 DNA 甲基轉移酶甲基化，形成 5-methylcytosine。 哺乳動物基因體中 70–80% 的 CpG 位點是甲基化的；啟動子的 CpG island 甲基化 → 基因沉默（gene silencing），為表觀遺傳核心機制。 5-methylcytosine 去胺化會變成 thymine（真核 C→T 突變熱點）。 Dam methylation（原核 E. coli）甲基的是 GATC 序列中的 adenine，用於 MMR 模板辨識（見 8.5.3）。 國考常見陷阱： • 真核 = 胞嘧啶（Cytosine）甲基化（於 CpG） • 原核 E. coli = 腺嘌呤（Adenine）甲基化（於 GATC，Dam）