本章分類時把一些和 DNA 酵素活性相關的題目也收了進來（因為它們核心是「酵素活性」而非「DNA 過程」），這裡簡短交代，詳細機制請看第七章。

DNA 聚合酶的三種酵素活性

大腸桿菌 DNA polymerase I 被 Arthur Kornberg 純化出來時，發現它同時具備三種活性：

🐆 考題重點

• DNA 合成時校對的活性是 3'→5' exonuclease。為什麼是 3'→5'？因為新的核苷酸是加在引子（primer）的 3' 端；如果剛加上去的錯了，要從 3' 端「退後一格」剪掉，所以是 3'→5' 方向。
• 真核細胞的 DNA polymerase δ（真正做 leading strand 延伸）和 ε 都保留了 3'→5' proofreading 活性；但 polymerase α（做 primer）和 polymerase β（修補）沒有校對能力。

PCNA 與 β-clamp：滑動夾（sliding clamp）

DNA 聚合酶本身抓 DNA 抓得不是很緊，加完一個核苷酸可能就會掉下來，這會讓複製變得超慢。

解決方法是使用滑動夾：一個圓環形的蛋白質穿過 DNA，然後把聚合酶鎖在圓環上。聚合酶被滑動夾卡著，每合成完一個鹼基不會掉，這個特性叫持續合成能力（processivity）。

• 大腸桿菌：β subunit（DNA polymerase III 的滑動夾）
• 真核細胞：PCNA（proliferating cell nuclear antigen）

兩者沒有胺基酸序列的同源性，但三維結構幾乎一樣，都是三聚體圍成的環形，這是蛋白質演化史上的經典趨同演化（convergent evolution）案例。

PCNA 和 β-clamp 的功能都是增加聚合酶的持續合成能力，它們本身不參與校對、不增加聚合速率、沒有核酸外切活性。