RNA pol I → rRNA(28S、18S、5.8S);pol II → mRNA;pol III → tRNA + 5S rRNA。
原核 RNA pol 在延伸階段 σ 參與最少(σ 主要負責 promoter 辨識)。
Rifampicin 抑制原核 RNA pol(轉錄),不是抑制轉譯。
真核 pol II promoter:TATA box 位於 –25~–30 bp,TBP(TFIID) 辨識。
TFIIH 具 helicase + kinase + ATPase 活性;不參與終止。
真核 mRNA 5' cap = 7-methylguanosine 以 5'-5' 三磷酸鍵倒接於 mRNA 第一核苷酸。
Poly-A signal = AAUAAA;加工全在核內完成,不是 ER/Golgi。
Shine-Dalgarno 與 30S 的 16S rRNA 3' 端配對,是原核起始特徵;真核用 5' cap + eIF4E。
IRES 允許真核 cap-independent 轉譯。
Lac operon:lacI 編碼 repressor、lacZ = β-gal、lacY = permease、lacA = transacetylase。
Trp operon attenuation:leader peptide 帶 Trp codon 感測 Trp 含量;高 Trp → 3-4 莖環 → 提前終止。
Repressor 是蛋白(具 allosteric 特性);operator、promoter、attenuator、enhancer 是 DNA;inducer 是小分子。
Helix-turn-helix 是原核調控蛋白與真核 homeodomain 共通模體。
HAT 乙醯化組蛋白 → 轉錄活化;HDAC 去乙醯化 → 轉錄沉默。
起始胺基酸:原核 fMet;真核 Met。
tRNA 3' 端 = –CCA–3'-OH(通用);Peptidyl transferase = 23S/28S rRNA 的核酶活性。
Wobble:codon 第 3 位 × anticodon 第 1 位;inosine 可配 U/A/C。
Aminoacyl-tRNA synthetase:用 ATP(不是 GTP),每肽鍵耗 2 高能磷酸鍵;把胺基酸接到 tRNA 3' CCA(酯化)。
轉譯延長順序:① aminoacyl-tRNA 進 A → ② 肽鍵形成 → ③ 轉位 → ④ tRNA 離 E。肽鍵形成不直接耗 GTP/ATP(peptidyl transferase 是核酶)。
E3 = ubiquitin ligase;泛素接在目標蛋白的 Lys;泛素化蛋白由 26S proteasome(不是 lysosome)降解。